12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1771 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1771  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  793    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219418  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1350  hypothetical protein  50.38 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2164  M48 family peptidase  29.95 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.777176 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11231  CaaX prenyl protease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI78]  25.14 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.306562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1907  peptidase M48, Ste24p  28.08 
 
 		 291 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.271345 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4501  peptidase M48  28.64 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.274182  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4955  peptidase M48 Ste24p  26.85 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1553  peptidase M48 Ste24p  26.87 
 
 		 344 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.955824  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1287  peptidase M48 Ste24p  28 
 
 		 291 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.899004 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2172  hypothetical protein  26.36 
 
 		 346 aa  43.1  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1434  peptidase M48, Ste24p  28.22 
 
 		 291 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.214994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1164  peptidase M48 Ste24p  28.41 
 
 		 405 aa  43.1  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>