259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0327 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
336 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  79.76 
 
 
329 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  66.88 
 
 
336 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  66.24 
 
 
336 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  65.92 
 
 
339 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0575  glycosyl transferase family protein  54.43 
 
 
323 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596232  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4143  glycosyl transferase family protein  54.74 
 
 
323 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0555  glycosyl transferase family protein  54.1 
 
 
326 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0570  glycosyl transferase family protein  54.1 
 
 
326 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3133  glycosyl transferase family protein  54.1 
 
 
326 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0102  glycosyl transferase family protein  54.1 
 
 
326 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1487  glycosyl transferase family protein  54.1 
 
 
326 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2916  glycosyl transferase family protein  54.1 
 
 
326 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0738  glycosyl transferase family protein  54.41 
 
 
354 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0490  glycosyl transferase family protein  51.85 
 
 
369 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2871  glycosyl transferase family protein  52.66 
 
 
332 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2822  glycosyl transferase family protein  53.7 
 
 
324 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2197  glycosyl transferase family protein  53.85 
 
 
324 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2811  glycosyl transferase family protein  53.85 
 
 
324 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0305  glycosyl transferase family protein  53.75 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  48.21 
 
 
301 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0461  glycosyl transferase family protein  53.8 
 
 
354 aa  241  9e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6141  glycosyl transferase family protein  52.16 
 
 
324 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2729  glycosyl transferase family protein  52.66 
 
 
332 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  49.5 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  48.21 
 
 
309 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  47.13 
 
 
309 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  47.13 
 
 
309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3280  glycosyl transferase family protein  45.34 
 
 
301 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114088  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1487  glycosyl transferase family protein  45.54 
 
 
319 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  42.24 
 
 
329 aa  212  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  44.37 
 
 
301 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  44.73 
 
 
308 aa  212  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1594  glycosyl transferase family protein  45.54 
 
 
319 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1780  glycosyl transferase family protein  45.54 
 
 
319 aa  212  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.301488 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3296  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 
304 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0655575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0824  glycosyl transferase family protein  41.06 
 
 
320 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.993844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  44.73 
 
 
307 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2320  glycosyl transferase family protein  46.91 
 
 
318 aa  203  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101648  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1467  glycosyl transferase family protein  44.04 
 
 
319 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00767  hypothetical protein  40.73 
 
 
320 aa  202  9e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0855  glycosyl transferase family protein  40.73 
 
 
320 aa  202  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2842  Glycosyl transferase, family 3-like protein  40.73 
 
 
320 aa  202  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2843  glycosyl transferase family protein  40.73 
 
 
320 aa  202  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00784  hypothetical protein  40.73 
 
 
320 aa  202  9e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  40.73 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  40.73 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2369  glycosyl transferase family protein  44.34 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0885  glycosyl transferase family protein  41.72 
 
 
324 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0949  glycosyl transferase family protein  41.39 
 
 
324 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0858  glycosyl transferase family protein  41.72 
 
 
324 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0917  glycosyl transferase family protein  41.39 
 
 
324 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  40.07 
 
 
321 aa  199  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2552  glycosyl transferase family protein  39.74 
 
 
320 aa  198  9e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0970  glycosyl transferase family protein  41.39 
 
 
324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  39.67 
 
 
302 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2882  glycosyl transferase family protein  42.9 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2397  glycosyl transferase family protein  43.19 
 
 
322 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1580  glycosyl transferase family protein  41.91 
 
 
322 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2494  glycosyl transferase family protein  40.73 
 
 
322 aa  179  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  34.88 
 
 
327 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  32.52 
 
 
333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  31.71 
 
 
333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  34.92 
 
 
327 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  34.26 
 
 
333 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  34.93 
 
 
328 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  33.47 
 
 
333 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  33.47 
 
 
333 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  35.06 
 
 
331 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  31.3 
 
 
333 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  33.07 
 
 
334 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  33.06 
 
 
332 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  25.56 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 
337 aa  86.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1301  hypothetical protein  27.3 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21741  hypothetical protein  27.3 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.349556  normal  0.259448 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1873  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.597248  hitchhiker  0.00000310641 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  23.98 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2176  Glycosyl transferase, family 3-like protein  27.51 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.261801  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  28.35 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4280  hypothetical protein  30.65 
 
 
506 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0681  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.02 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  33.49 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5575  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.84 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1507  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  27.6 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1233  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  26.82 
 
 
544 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0375955  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1680  hypothetical protein  29.18 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.99598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3100  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.42 
 
 
345 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5395  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.84 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29911  hypothetical protein  28.28 
 
 
368 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2016  anthranilate phosphoribosyltransferase  32.48 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0352471  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0692  anthranilate phosphoribosyltransferase  22.48 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 
339 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0530103  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4702  Glycosyl transferase, family 3-like protein  29.05 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1586  Anthranilate phosphoribosyltransferase  25.59 
 
 
361 aa  63.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1734  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 
337 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66057  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4671  anthranilate phosphoribosyltransferase  34.19 
 
 
337 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2767  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
390 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.0391357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>