298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3540 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  48.97 
 
 
694 aa  661    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1958  Polyphosphate kinase  49.49 
 
 
717 aa  637    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.17546 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  50 
 
 
749 aa  644    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12999  polyphosphate kinase  50.65 
 
 
741 aa  650    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  55.82 
 
 
713 aa  738    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  52.66 
 
 
760 aa  668    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1011  Polyphosphate kinase  53.57 
 
 
729 aa  676    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  56.34 
 
 
743 aa  759    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  55.47 
 
 
700 aa  729    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  51.45 
 
 
731 aa  665    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09100  polyphosphate kinase  52.1 
 
 
743 aa  671    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378192  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  49.56 
 
 
788 aa  640    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  48.99 
 
 
702 aa  635    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  50.5 
 
 
727 aa  649    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  51.24 
 
 
702 aa  670    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  48.68 
 
 
709 aa  665    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1116  polyphosphate kinase  51.23 
 
 
738 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18301  polyphosphate kinase  48.84 
 
 
705 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1195  polyphosphate kinase  52.41 
 
 
728 aa  712    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  48.7 
 
 
745 aa  668    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000685763 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  50.22 
 
 
766 aa  665    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  54.33 
 
 
736 aa  741    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  51.03 
 
 
721 aa  662    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  50.14 
 
 
710 aa  645    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  53.08 
 
 
708 aa  709    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  54.89 
 
 
707 aa  741    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  49.71 
 
 
713 aa  680    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  53.47 
 
 
696 aa  713    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  51.32 
 
 
707 aa  701    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  50.57 
 
 
712 aa  684    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  53.46 
 
 
721 aa  731    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  53.16 
 
 
731 aa  720    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  49.48 
 
 
692 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  54.66 
 
 
731 aa  761    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  49.63 
 
 
715 aa  646    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  65.1 
 
 
700 aa  880    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3618  polyphosphate kinase  52.08 
 
 
750 aa  657    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  51.32 
 
 
744 aa  669    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  53.24 
 
 
720 aa  715    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  51.69 
 
 
715 aa  698    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  62.12 
 
 
695 aa  863    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  51.84 
 
 
729 aa  675    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  49.56 
 
 
788 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  51.23 
 
 
728 aa  668    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5220  Polyphosphate kinase  49.28 
 
 
703 aa  645    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1153  polyphosphate kinase  52.62 
 
 
769 aa  664    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.862565  unclonable  0.0000000856651 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  54.63 
 
 
722 aa  756    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  53.32 
 
 
721 aa  723    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  55.17 
 
 
701 aa  735    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  49.57 
 
 
745 aa  664    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  49.64 
 
 
749 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  47.83 
 
 
709 aa  665    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  50.66 
 
 
712 aa  663    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  53.47 
 
 
709 aa  727    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29941  polyphosphate kinase  51.06 
 
 
712 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1925  polyphosphate kinase  52.06 
 
 
742 aa  653    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  54.22 
 
 
702 aa  707    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  55.8 
 
 
743 aa  779    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  52.06 
 
 
705 aa  662    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  52.06 
 
 
742 aa  653    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  51.59 
 
 
720 aa  710    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18871  polyphosphate kinase  48.02 
 
 
692 aa  661    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  54.63 
 
 
722 aa  756    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  100 
 
 
708 aa  1449    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  50.14 
 
 
762 aa  670    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  52.31 
 
 
691 aa  680    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  49.36 
 
 
790 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  49.78 
 
 
749 aa  650    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3000  Polyphosphate kinase  50.22 
 
 
693 aa  641    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028074 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19061  polyphosphate kinase  49.19 
 
 
692 aa  664    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.547171  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1482  polyphosphate kinase  53.06 
 
 
763 aa  677    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622113  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  52.68 
 
 
709 aa  720    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3822  polyphosphate kinase  48.58 
 
 
702 aa  637    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4257  polyphosphate kinase  51.12 
 
 
696 aa  651    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0705016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  54.2 
 
 
714 aa  738    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1971  polyphosphate kinase  52.06 
 
 
742 aa  653    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48971  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  90.82 
 
 
708 aa  1284    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2139  polyphosphate kinase  51.98 
 
 
730 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.343146  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  52.86 
 
 
713 aa  726    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3211  Polyphosphate kinase  51.09 
 
 
737 aa  664    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2027  polyphosphate kinase  49.06 
 
 
788 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632434  normal  0.646529 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  50.07 
 
 
765 aa  661    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  51.12 
 
 
687 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  48.44 
 
 
702 aa  633  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  48.64 
 
 
702 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  48.64 
 
 
702 aa  634  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  48.64 
 
 
702 aa  634  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  46.52 
 
 
681 aa  634  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  48.64 
 
 
702 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  48.64 
 
 
702 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  49.21 
 
 
750 aa  633  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  48.3 
 
 
700 aa  631  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  47.88 
 
 
702 aa  630  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0214  polyphosphate kinase  48.93 
 
 
694 aa  630  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03530  polyphosphate kinase  48.92 
 
 
770 aa  627  1e-178  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270517  normal  0.858348 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0464  polyphosphate kinase  46.78 
 
 
712 aa  627  1e-178  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.698242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  49.13 
 
 
882 aa  627  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  50.9 
 
 
726 aa  626  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2654  polyphosphate kinase  48.42 
 
 
736 aa  622  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8258  Polyphosphate kinase  49.14 
 
 
697 aa  624  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>