18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2589 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2589  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  261  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.744125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0811  Limonene-12-epoxide hydrolase  64.52 
 
 		 128 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333628  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2590  hypothetical protein  62.81 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1913  limonene-12-epoxide hydrolase  47.54 
 
 		 132 aa  97.1  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5231  limonene-1,2-epoxide hydrolase  40.5 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.486907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2578  Limonene-12-epoxide hydrolase  39.67 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2094  limonene-1,2-epoxide hydrolase  33.05 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4611  limonene-1,2-epoxide hydrolase  33.33 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1024  limonene-1,2-epoxide hydrolase  35.94 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.903777  normal  0.0576424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1540  Limonene-12-epoxide hydrolase  34.48 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5375  limonene-1,2-epoxide hydrolase  45.45 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4895  limonene-12-epoxide hydrolase  45.45 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2991  limonene-1,2-epoxide hydrolase  45.45 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0903  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.96 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12753  hypothetical protein  36.56 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384763  normal  0.0262942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2115  limonene-1,2-epoxide hydrolase  40 
 
 		 149 aa  42  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2174  limonene-1,2-epoxide hydrolase  40 
 
 		 149 aa  42  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.289892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2128  limonene-1,2-epoxide hydrolase  40 
 
 		 149 aa  42  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>