45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1557 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1557  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  254  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1666  hypothetical protein  82.79 
 
 		 130 aa  183  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.361842  hitchhiker  0.00498054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1996  putative transmembrane protein  79.69 
 
 		 130 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1129  hypothetical protein  68.47 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00728064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1248  transmembrane protein  70.43 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4599  membrane protein  61.16 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  0.568501 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1335  membrane protein-like protein  63.83 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3070  transmembrane protein  50 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  hitchhiker  0.000683085 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1432  membrane protein  63.83 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0972  membrane protein  63.83 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1454  membrane protein  63.83 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1375  membrane protein  62.77 
 
 		 130 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  56.19 
 
 		 115 aa  113  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2775  hypothetical protein  55.26 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1199  membrane protein-like protein  58.59 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.553066  normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1118  membrane protein-like protein  58.59 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1861  membrane protein-like protein  62.89 
 
 		 136 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2778  hypothetical protein  55.14 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1352  hypothetical protein  56.14 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433588  normal  0.260577 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2990  membrane protein-like  54 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2620  hypothetical protein  57.78 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  50 
 
 		 135 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4967  membrane protein-like protein  50.89 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1473  hypothetical protein  57.3 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0940  hypothetical protein  57.3 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0408  hypothetical protein  57.3 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1705  hypothetical protein  57.3 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0754  hypothetical protein  57.3 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0981  membrane protein-like protein  45.13 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1453  membrane protein-like  54.92 
 
 		 140 aa  97.1  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1577  hypothetical protein  57 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  53 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1683  hypothetical protein  56.18 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0866  membrane protein-like protein  45.54 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.060146  normal  0.425014 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2770  membrane protein-like protein  51 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0344559 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3783  membrane protein-like protein  53.91 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  35.29 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1518  putative transmembrane protein  44.55 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1421  putative transmembrane protein  48.91 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00663896 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0519  putative transmembrane protein  40.91 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.978517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4561  hypothetical protein  32.74 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.672359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52000  hypothetical protein  32.74 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4074  hypothetical protein  33.93 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  29.6 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1643  hypothetical protein  32.43 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>