45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1547 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1547  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  502  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5893  hypothetical protein  44.73 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.369953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0195  hypothetical protein  43.9 
 
 		 245 aa  181  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0377227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0189  hypothetical protein  43.15 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.992964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5207  hypothetical protein  43.7 
 
 		 247 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.371922 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0952  hypothetical protein  28.15 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1140  hypothetical protein  26.81 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1367  hypothetical protein  26.81 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1402  hypothetical protein  26.81 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1325  hypothetical protein  27.23 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000993425 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1166  hypothetical protein  27.23 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1257  hypothetical protein  27.23 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1146  hypothetical protein  26.81 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1153  hypothetical protein  24.39 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1301  hypothetical protein  25.96 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4042  hypothetical protein  25.96 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0831  hypothetical protein  29.67 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.398409  normal  0.103006 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5825  hypothetical protein  27.09 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal  0.141367 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0802  hypothetical protein  25.88 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2540  hypothetical protein  28.69 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551168  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2411  hypothetical protein  28.29 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0337144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2485  hypothetical protein  28.57 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2493  hypothetical protein  40.91 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1882  hypothetical protein  40.91 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2518  hypothetical protein  40.91 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2588  hypothetical protein  29.52 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3247  hypothetical protein  29.79 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1902  hypothetical protein  38.38 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2074  hypothetical protein  37.21 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00116266  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2481  hypothetical protein  39.33 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2100  hypothetical protein  49.15 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0318344  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0994  hypothetical protein  38.37 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0987  hypothetical protein  38.37 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000850612  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0310  hypothetical protein  38.82 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000655656 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0267  hypothetical protein  38.37 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000473474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0881  hypothetical protein  38.37 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000368123  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0944  hypothetical protein  38.37 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0686007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1147  hypothetical protein  38.37 
 
 		 308 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00273813  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2077  hypothetical protein  37.23 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0789  hypothetical protein  39.02 
 
 		 222 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5555  Protein of unknown function DUF2278  26.56 
 
 		 333 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794504  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03243  conserved hypothetical protein  27.17 
 
 		 335 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0554408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2147  hypothetical protein  38.1 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.94872  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2457  hypothetical protein  35.63 
 
 		 274 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1875  hypothetical protein  22.94 
 
 		 197 aa  46.2  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000463355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>