40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2074 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2074  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00116266  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2481  hypothetical protein  61.61 
 
 		 231 aa  281  5.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2147  hypothetical protein  54.63 
 
 		 212 aa  249  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.94872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2100  hypothetical protein  56.25 
 
 		 220 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0318344  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1902  hypothetical protein  53.37 
 
 		 220 aa  238  6.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0310  hypothetical protein  55.66 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000655656 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2077  hypothetical protein  44.19 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5555  Protein of unknown function DUF2278  28.57 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0831  hypothetical protein  28.02 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.398409  normal  0.103006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3247  hypothetical protein  29.03 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1402  hypothetical protein  25.64 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2588  hypothetical protein  30.54 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1367  hypothetical protein  25.85 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4042  hypothetical protein  25.11 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1547  hypothetical protein  37.21 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1146  hypothetical protein  25.64 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1140  hypothetical protein  25.32 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1301  hypothetical protein  24.57 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1325  hypothetical protein  25.64 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000993425 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1166  hypothetical protein  25.64 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1257  hypothetical protein  25.64 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0789  hypothetical protein  21.35 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2485  hypothetical protein  26.69 
 
 		 347 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1153  hypothetical protein  24.79 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2457  hypothetical protein  30.92 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0987  hypothetical protein  21.35 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000850612  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0994  hypothetical protein  21.35 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0944  hypothetical protein  22.56 
 
 		 306 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0686007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0267  hypothetical protein  22.56 
 
 		 306 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000473474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0881  hypothetical protein  22.56 
 
 		 306 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000368123  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1147  hypothetical protein  21.35 
 
 		 308 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00273813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0952  hypothetical protein  24.46 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5825  hypothetical protein  22.5 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal  0.141367 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2493  hypothetical protein  23.15 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1882  hypothetical protein  23.15 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2518  hypothetical protein  23.15 
 
 		 223 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2540  hypothetical protein  21.43 
 
 		 223 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551168  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08549  conserved hypothetical protein  25.15 
 
 		 399 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03243  conserved hypothetical protein  33.71 
 
 		 335 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0554408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2411  hypothetical protein  22 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0337144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>