40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0195 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0195  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0377227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0189  hypothetical protein  92.24 
 
 		 245 aa  473  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.992964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5207  hypothetical protein  63.01 
 
 		 247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.371922 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5893  hypothetical protein  60.57 
 
 		 246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.369953  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1547  hypothetical protein  43.9 
 
 		 242 aa  181  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0831  hypothetical protein  31.65 
 
 		 334 aa  78.6  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.398409  normal  0.103006 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0802  hypothetical protein  30.71 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2540  hypothetical protein  31.91 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0952  hypothetical protein  26.03 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1367  hypothetical protein  28.51 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5825  hypothetical protein  32.45 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal  0.141367 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4042  hypothetical protein  28.51 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1140  hypothetical protein  28.51 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2493  hypothetical protein  31.91 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1882  hypothetical protein  31.91 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2518  hypothetical protein  31.91 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1402  hypothetical protein  28.51 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1325  hypothetical protein  28.05 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000993425 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1146  hypothetical protein  28.05 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1301  hypothetical protein  28.05 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2588  hypothetical protein  29.68 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2411  hypothetical protein  30.85 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0337144 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1257  hypothetical protein  28.05 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1166  hypothetical protein  28.05 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1153  hypothetical protein  26.7 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0994  hypothetical protein  28.35 
 
 		 222 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0987  hypothetical protein  28.35 
 
 		 222 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000850612  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1147  hypothetical protein  28.35 
 
 		 308 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00273813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0267  hypothetical protein  30.32 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000473474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0881  hypothetical protein  30.32 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000368123  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0944  hypothetical protein  30.32 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0686007  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3247  hypothetical protein  29.91 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2485  hypothetical protein  28.12 
 
 		 347 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0789  hypothetical protein  28.72 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2100  hypothetical protein  43.08 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0318344  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2457  hypothetical protein  28.67 
 
 		 274 aa  48.9  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2077  hypothetical protein  45 
 
 		 219 aa  48.9  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0310  hypothetical protein  44.64 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000655656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5555  Protein of unknown function DUF2278  25.45 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1902  hypothetical protein  39.74 
 
 		 220 aa  42.4  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>