43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2481 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2481  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  484  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2074  hypothetical protein  61.61 
 
 
221 aa  281  6.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00116266  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2147  hypothetical protein  56.02 
 
 
212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.94872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2100  hypothetical protein  56.81 
 
 
220 aa  247  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0318344  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0310  hypothetical protein  57.01 
 
 
218 aa  239  4e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000655656 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1902  hypothetical protein  53.95 
 
 
220 aa  228  7e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2077  hypothetical protein  42.79 
 
 
219 aa  165  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0952  hypothetical protein  25.65 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0802  hypothetical protein  22.55 
 
 
223 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5825  hypothetical protein  23.59 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal  0.141367 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1367  hypothetical protein  24.78 
 
 
227 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2540  hypothetical protein  22.96 
 
 
223 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5555  Protein of unknown function DUF2278  28.33 
 
 
333 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794504  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4042  hypothetical protein  24.78 
 
 
227 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0789  hypothetical protein  22.84 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1882  hypothetical protein  22.34 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2493  hypothetical protein  22.34 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1301  hypothetical protein  24.78 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2518  hypothetical protein  22.34 
 
 
223 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3247  hypothetical protein  30.67 
 
 
340 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2411  hypothetical protein  22.45 
 
 
223 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0337144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1402  hypothetical protein  23.91 
 
 
227 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2588  hypothetical protein  28.57 
 
 
335 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0987  hypothetical protein  22.84 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000850612  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0994  hypothetical protein  22.84 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1547  hypothetical protein  39.33 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1146  hypothetical protein  24.11 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1140  hypothetical protein  23.66 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0881  hypothetical protein  22.84 
 
 
306 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000368123  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0944  hypothetical protein  22.84 
 
 
306 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0686007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1257  hypothetical protein  24.11 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1147  hypothetical protein  22.84 
 
 
308 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00273813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0831  hypothetical protein  26.89 
 
 
334 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.398409  normal  0.103006 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1166  hypothetical protein  24.11 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0267  hypothetical protein  22.84 
 
 
306 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000473474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1325  hypothetical protein  23.66 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000993425 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1875  hypothetical protein  34.62 
 
 
197 aa  48.9  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000463355  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03243  conserved hypothetical protein  29.56 
 
 
335 aa  48.5  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0554408  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1153  hypothetical protein  22.61 
 
 
227 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2457  hypothetical protein  30.26 
 
 
274 aa  45.4  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2485  hypothetical protein  39.39 
 
 
347 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5207  hypothetical protein  40.79 
 
 
247 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.371922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0189  hypothetical protein  37.5 
 
 
245 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.992964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>