70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1480 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1480  lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 177 aa  362  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.028098  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1438  lipoprotein transmembrane  86.05 
 
 		 172 aa  300  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.565531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1374  putative lipoprotein transmembrane  85.47 
 
 		 172 aa  296  9e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.399659  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2071  hypothetical protein  67.79 
 
 		 173 aa  204  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1899  hypothetical protein  64.47 
 
 		 201 aa  204  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  0.292321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2222  putative transmembrane protein  66.43 
 
 		 150 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0954  lipoprotein transmembrane  52 
 
 		 175 aa  174  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3222  putative lipoprotein  52.76 
 
 		 183 aa  168  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1336  putative lipoprotein  51.48 
 
 		 183 aa  168  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130729  normal  0.043389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1021  hypothetical protein  57.25 
 
 		 170 aa  164  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2016  putative lipoprotein  57.25 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0546155  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6448  putative lipoprotein  48.52 
 
 		 168 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.961477  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1053  putative lipoprotein  56.52 
 
 		 216 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000833656  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5584  hypothetical protein  55.8 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60834  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1427  putative lipoprotein  55.8 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1838  putative lipoprotein  55.8 
 
 		 170 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1282  putative lipoprotein  55.8 
 
 		 166 aa  157  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0745  putative lipoprotein  55.8 
 
 		 166 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1289  putative lipoprotein  55.8 
 
 		 166 aa  157  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0404  putative lipoprotein  55.8 
 
 		 166 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1121  putative lipoprotein  55.8 
 
 		 166 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2280  hypothetical protein  55.07 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282799  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2173  hypothetical protein  55.07 
 
 		 170 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1644  hypothetical protein  55.07 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2294  hypothetical protein  54.35 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075396  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2256  hypothetical protein  55.07 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0919  hypothetical protein  48.19 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.600843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4746  lipoprotein transmembrane  44.91 
 
 		 171 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398301  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4200  transmembrane protein  45.4 
 
 		 171 aa  130  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4572  putative transmembrane protein  50 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.686255  normal  0.728328 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3500  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0357475  normal  0.416536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5584  hypothetical protein  43.64 
 
 		 170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5112  putative lipoprotein transmembrane  35.14 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4052  putative lipoprotein transmembrane  36.36 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0388  putative lipoprotein transmembrane  40 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3397  putative lipoprotein transmembrane  36.84 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.504524  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0832  putative lipoprotein transmembrane  36.76 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0268  putative lipoprotein transmembrane  33.91 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2854  putative lipoprotein  36.97 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2734  putative lipoprotein  36.97 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2793  putative lipoprotein  36.97 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1770  putative lipoprotein  36.97 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3111  hypothetical protein  33.91 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2929  putative lipoprotein  35.14 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1552  putative lipoprotein  35.14 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1356  hypothetical protein  32.61 
 
 		 172 aa  62  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4689  putative lipoprotein transmembrane  33.59 
 
 		 167 aa  62  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1794  putative lipoprotein  29.94 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2130  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.657299 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4286  hypothetical protein  31.3 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2595  putative lipoprotein  30.89 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0673  lipoprotein  30.25 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1150  hypothetical protein  30.23 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.35893 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1174  hypothetical protein  31.54 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496107  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0695  hypothetical protein  31.54 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1056  hypothetical protein  31.54 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2770  hypothetical protein  27.87 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.172738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1053  hypothetical protein  31.78 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2191  lipoprotein  29.27 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.768986  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3837  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139182  normal  0.877225 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2382  lipoprotein  29.6 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4089  putative lipoprotein  27.91 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4094  hypothetical protein  33.68 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0047  hypothetical protein  26.02 
 
 		 164 aa  47.8  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0604  lipoprotein  27.34 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2813  putative lipoprotein  27.65 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3490  putative lipoprotein  27.43 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0959  putative lipoprotein  28.46 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1840  putative lipoprotein  25.78 
 
 		 165 aa  41.6  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0582073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0908  putative lipoprotein  27.81 
 
 		 173 aa  41.2  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>