30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4092 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_4092    100 
 
 		 489 bp  969    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8229    93.18 
 
 		 831 bp  63.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174563  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  93.18 
 
 		 1101 bp  63.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8196    93.18 
 
 		 1100 bp  63.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8192    93.18 
 
 		 792 bp  63.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  93.18 
 
 		 1098 bp  63.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9090    93.18 
 
 		 1093 bp  63.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8061    93.18 
 
 		 1096 bp  63.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8247    93.18 
 
 		 642 bp  63.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  83.16 
 
 		 1086 bp  61.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  83.16 
 
 		 1086 bp  61.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  83.16 
 
 		 1086 bp  61.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6339    86.89 
 
 		 868 bp  58  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  94.44 
 
 		 1089 bp  56  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  94.44 
 
 		 1089 bp  56  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  94.44 
 
 		 1089 bp  56  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  94.44 
 
 		 1170 bp  56  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  96.88 
 
 		 1068 bp  56  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  87.27 
 
 		 1089 bp  54  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  86.44 
 
 		 1092 bp  54  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  86.44 
 
 		 1881 bp  54  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  87.27 
 
 		 1089 bp  54  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  89.36 
 
 		 1101 bp  54  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  89.36 
 
 		 1092 bp  54  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0513  transposase  88 
 
 		 864 bp  52  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0493    88 
 
 		 1077 bp  52  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1944  hypothetical protein  90 
 
 		 465 bp  48.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.181945  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0765    93.55 
 
 		 1113 bp  46.1  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.655086  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  87.23 
 
 		 1086 bp  46.1  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  87.23 
 
 		 1086 bp  46.1  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>