69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2540 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1199  twin arginine-targeting protein translocase  100 
 
 		 70 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0780596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2540  twin-arginine translocation system protein, TatA  100 
 
 		 70 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.540586  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1983  twin arginine-targeting protein translocase  98.57 
 
 		 70 aa  137  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.830772  normal  0.0374127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1343  Sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  70.27 
 
 		 74 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.139725 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1797  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  71.83 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00956825  normal  0.0641445 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1209  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  76.92 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3830  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  69.57 
 
 		 63 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3158 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3102  Sec-independent protein translocase TatE  69.57 
 
 		 63 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.101906  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0907  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  76.27 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4481  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3708  twin arginine translocase protein A  50.82 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0454657  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3399  twin arginine translocase protein A  50.82 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3590  twin arginine translocase protein A  50.82 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.744358  normal  0.70676 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1094  twin arginine-targeting protein translocase  42.19 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2764  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0594411  normal  0.122404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  38.16 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  40.3 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2183  twin arginine translocase protein A  44.26 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2485  twin arginine translocase protein A  60.53 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359725  normal  0.0181942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  38.16 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2705  twin arginine translocase protein A  39.13 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  40.32 
 
 		 79 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  41.94 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2745  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2610  twin arginine-targeting protein translocase  42.86 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0589  twin arginine translocase protein A  47.83 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.905934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3119  twin arginine-targeting protein translocase  48.78 
 
 		 74 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0514819  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  37.7 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  42.37 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  37.5 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3930  twin arginine translocase protein A  52.63 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1685  twin arginine translocase protein A  39.13 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1487  twin arginine translocase protein A  44.9 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0524  twin arginine-targeting protein translocase  33.33 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4407  twin arginine translocase protein A  66.67 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3027  twin arginine-targeting protein translocase  46.81 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0152  mttA/Hcf106 family protein  35.85 
 
 		 55 aa  42.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1143  twin arginine translocase protein A  37.04 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  32.35 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  32.35 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  32.35 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  32.35 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  32.35 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2668  SEC-independent protein translocase protein  47.22 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.598915  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  33.82 
 
 		 84 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1164  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0248599  normal  0.16996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  38.6 
 
 		 79 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2345  twin arginine translocase protein A  52.94 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172341  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0320  twin arginine-targeting protein translocase  33.33 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0016  twin arginine-targeting protein translocase  54.05 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3157  twin arginine translocase protein A  33.85 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000988339  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3912  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.79 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4244  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.85 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3942  twin arginine-targeting protein translocase  36.07 
 
 		 88 aa  40.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3638  Sec-independent protein translocase protein TatA  36.07 
 
 		 88 aa  40.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0274  twin arginine-targeting protein translocase TatA  36.07 
 
 		 88 aa  40.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1909  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.67 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.925772  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  37.14 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0873  twin arginine translocase protein A  52.94 
 
 		 80 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0882  twin arginine translocase protein A  52.94 
 
 		 80 aa  40  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>