29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1959 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1959    100 
 
 		 336 bp  666    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0610    99.11 
 
 		 397 bp  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  94.72 
 
 		 354 bp  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3010    84.4 
 
 		 1167 bp  186  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3505  hypothetical protein  91.8 
 
 		 189 bp  163  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.151304  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0936  IS66 Orf2 family protein  91.8 
 
 		 357 bp  163  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13199  normal  0.621518 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1960    100 
 
 		 519 bp  121  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4180    89.16 
 
 		 177 bp  93.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0658  IS66 Orf2 family protein  83.62 
 
 		 354 bp  79.8  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9622  transposase  83.02 
 
 		 354 bp  67.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1435    92 
 
 		 590 bp  67.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4284    94.74 
 
 		 980 bp  60  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  94.74 
 
 		 387 bp  60  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3308  IS66 Orf2 family protein  89.8 
 
 		 354 bp  58  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8248  transposase  92.5 
 
 		 354 bp  56  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8230  transposase  92.5 
 
 		 354 bp  56  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1210    89.58 
 
 		 311 bp  56  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0916  IS66 Orf2 family protein  80.49 
 
 		 354 bp  54  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.970798  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4309  hypothetical protein  80.49 
 
 		 354 bp  54  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4304  hypothetical protein  80.49 
 
 		 354 bp  54  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3762  transposase IS66  80.49 
 
 		 354 bp  54  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3721  transposase IS66  80.49 
 
 		 354 bp  54  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3716  hypothetical protein  80.49 
 
 		 354 bp  54  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3517  hypothetical protein  80.49 
 
 		 354 bp  54  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.767717 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1808  IS66 Orf2 family protein  80.49 
 
 		 354 bp  54  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1418  IS66 Orf2 family protein  80.49 
 
 		 354 bp  54  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0170  IS66 Orf2 family protein  80.49 
 
 		 354 bp  54  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0432  IS66 Orf2 family protein  80.49 
 
 		 354 bp  54  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4166  transposase IS66  88 
 
 		 354 bp  52  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0244741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>