15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0055 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0055  flagellar protein FliH  100 
 
 		 274 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1690  hypothetical protein  96 
 
 		 271 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0395614  hitchhiker  0.000583749 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1643  hypothetical protein  63.92 
 
 		 264 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0152574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  26.97 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  25.52 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00979  flagellar assembly protein FliH  35.8 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06187  flagellar assembly protein FliH  35.8 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00312706  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  34.73 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  26.8 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  31.29 
 
 		 339 aa  47  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  31.11 
 
 		 303 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  24.49 
 
 		 334 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  23.53 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  27.21 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>