27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05692 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05692  putative transmembrane protein  100 
 
 		 540 aa  1079    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04763  hypothetical protein  100 
 
 		 540 aa  1079    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4231  amine oxidase  88.48 
 
 		 540 aa  957    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4119  amine oxidase  88.48 
 
 		 540 aa  957    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.0166866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3472  hypothetical protein  53.2 
 
 		 539 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4274  hypothetical protein  53.75 
 
 		 539 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4894  hypothetical protein  53.2 
 
 		 539 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4801  hypothetical protein  53.56 
 
 		 539 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.717214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5392  hypothetical protein  53.02 
 
 		 539 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0815  hypothetical protein  53.02 
 
 		 539 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3305  hypothetical protein  51.36 
 
 		 555 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0711795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3462  hypothetical protein  52.76 
 
 		 556 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3715  twin-arginine translocation pathway signal  42.47 
 
 		 550 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697054  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  33.39 
 
 		 536 aa  296  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0112  FAD dependent oxidoreductase  37.33 
 
 		 487 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0699636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5265  amine oxidase  38.33 
 
 		 543 aa  241  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4735  amine oxidase  40.64 
 
 		 582 aa  236  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4093  twin-arginine translocation pathway signal  39.06 
 
 		 583 aa  230  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.139116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0250  hypothetical protein  39.21 
 
 		 562 aa  226  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4784  twin-arginine translocation pathway signal  34.16 
 
 		 580 aa  177  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370329  normal  0.538612 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2225  hypothetical protein  55.17 
 
 		 58 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.444853  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2308  glycine/D-amino acid oxidases  56.9 
 
 		 58 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1722  hypothetical protein  53.45 
 
 		 58 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1929  hypothetical protein  53.45 
 
 		 58 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1656  hypothetical protein  53.45 
 
 		 58 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0705  hypothetical protein  54.72 
 
 		 53 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  33.98 
 
 		 462 aa  43.5  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>