39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02338 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02338  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  433  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0193452 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5366  transmembrane protein  40.59 
 
 		 222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3861  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.19 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0697193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3666  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.19 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal  0.519121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4503  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.19 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187217  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4884  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.88 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192734 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3265  PAP2 family membrane protein  32.61 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3277  PAP2 family protein  32.61 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2235  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.86 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  0.310017 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0594  PAP2 family protein  34.81 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2847  putative phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.9 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6188  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3758  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.42 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825096  normal  0.0238717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3229  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.42 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.427666 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1349  PAP2 family protein  34.06 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1479  PAP2 family membrane protein  38.24 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1675  PAP2 family protein  38.24 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.840167  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2563  major facilitator superfamily permease  38.24 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2426  PAP2 family membrane protein  38.24 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.691634  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0331  PAP2 family membrane protein  38.24 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821888  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1188  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.69 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0096  hypothetical protein  35.79 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134789  normal  0.826504 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0300  PAP2 family protein  38.24 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0866  PAP2 family protein  38.24 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5834  hypothetical protein  30.77 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4934  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.11 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4406  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.09 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265385  normal  0.277633 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5529  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.57 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3705  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.57 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6736  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.67 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6803  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.43 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.687594  hitchhiker  0.000000852518 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5919  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.61 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208723  normal  0.373663 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3228  PAP2 family membrane protein  32.61 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3727  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.49 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0651813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3721  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.29 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0369541  normal  0.206135 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7386  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.61 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4560  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.29 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3803  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.29 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.10058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2293  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.57 
 
 		 196 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>