17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4327 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4327  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4477  hypothetical protein  94.48 
 
 		 181 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.320227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1002  hypothetical protein  92.27 
 
 		 181 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4780  hypothetical protein  85.08 
 
 		 180 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472606  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0291  hypothetical protein  40 
 
 		 174 aa  124  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0267  hypothetical protein  40 
 
 		 174 aa  124  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.708651  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3117  hypothetical protein  38.89 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0466  hypothetical protein  44.29 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.978743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2118  hypothetical protein  44.29 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal  0.854449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2387  putative lipid carrier protein-like protein  44.29 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0557516 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6297  hypothetical protein  41.94 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3474  hypothetical protein  40.41 
 
 		 223 aa  99  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.498948  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3004  putative lipid carrier protein-like protein  45.69 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2400  putative lipid carrier protein-like protein  36.3 
 
 		 190 aa  85.1  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4227  hypothetical protein  39.26 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4295  putative lipid carrier protein-like  45.3 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3493  putative lipid carrier protein-like protein  27.15 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>