45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3127 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3127  ATP12 ATPase  100 
 
 		 261 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.922755  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2337  ATP12 ATPase  82.24 
 
 		 265 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0422337  normal  0.128949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3401  ATP12 ATPase  71.66 
 
 		 261 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0153972  normal  0.0790804 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1576  ATP12 ATPase  68.83 
 
 		 260 aa  348  7e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190684  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3622  ATP12 ATPase  74.14 
 
 		 261 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1398  chaperone required for the assembly of F1-ATPase  61.96 
 
 		 260 aa  308  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00511954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5031  hypothetical protein  59.68 
 
 		 260 aa  300  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2084  ATP12 ATPase  48.08 
 
 		 261 aa  241  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124056  normal  0.330862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0281  ATP12 ATPase  49.8 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1882  ATP12 ATPase  47.31 
 
 		 261 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0827011  normal  0.0218555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6370  ATP12 ATPase  51.24 
 
 		 262 aa  235  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0324  ATP12 ATPase  50 
 
 		 267 aa  234  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0357  ATP12 ATPase  50.83 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1003  hypothetical protein  45.98 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1017  ATP12 ATPase  48.47 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.388944  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7121  ATP12 ATPase  51.65 
 
 		 262 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2086  ATP12 ATPase  45.21 
 
 		 260 aa  225  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0969  hypothetical protein  46.75 
 
 		 234 aa  216  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1314  ATP12 ATPase  46.92 
 
 		 273 aa  214  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0853  ATP12 ATPase  50.62 
 
 		 263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.344242  decreased coverage  0.000239957 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0731  ATP12 chaperone family protein  39 
 
 		 261 aa  208  6e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0222594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4761  ATP12 ATPase  52.38 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2263  hypothetical protein  45 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1647  ATP12 ATPase  46.18 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.306499  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1746  hypothetical protein  44.69 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2101  ATP12 ATPase  48.92 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0392  ATP12 ATPase  44.25 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.647133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0293  ATP12 ATPase  43.36 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.553386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2712  ATP12 ATPase  44.54 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0317  ATP12 chaperone protein  39.56 
 
 		 234 aa  171  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2656  ATP12 ATPase  38.52 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.924505  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1759  ATP12 ATPase  41.38 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0792  ATP12 ATPase  41.12 
 
 		 236 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2504  ATP12 ATPase  41.67 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0626  ATP12 ATPase  43.07 
 
 		 237 aa  156  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2770  ATP12 ATPase  40.64 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77249  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2104  ATP12 ATPase  40.79 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1704  ATP12 ATPase  35.34 
 
 		 250 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2841  ATP12 ATPase  34.88 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0834474  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0490  ATP12 ATPase  34.63 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332583 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03060  hypothetical protein  33.82 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2681  ATP12 ATPase  37.86 
 
 		 233 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43255  predicted protein  36.19 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.917305 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50559  predicted protein  28.44 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09062  mitochondrial molecular chaperone (Atp12), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02490)  38.67 
 
 		 369 aa  50.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.488866  normal  0.0529685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>