46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2656 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2656  ATP12 ATPase  100 
 
 		 257 aa  511  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.924505  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2084  ATP12 ATPase  46.9 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124056  normal  0.330862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1882  ATP12 ATPase  45.58 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0827011  normal  0.0218555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0324  ATP12 ATPase  47.06 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0281  ATP12 ATPase  47.06 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1017  ATP12 ATPase  43.67 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.388944  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_004310  BR1003  hypothetical protein  40.83 
 
 		 260 aa  191  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2086  ATP12 ATPase  41.25 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0357  ATP12 ATPase  45.49 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1759  ATP12 ATPase  42.92 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0969  hypothetical protein  40.95 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0317  ATP12 chaperone protein  44.69 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0392  ATP12 ATPase  44.49 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.647133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1746  hypothetical protein  42.92 
 
 		 235 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6370  ATP12 ATPase  43.91 
 
 		 262 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7121  ATP12 ATPase  45.23 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2263  hypothetical protein  44.69 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1704  ATP12 ATPase  43.51 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2770  ATP12 ATPase  45.53 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77249  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0626  ATP12 ATPase  46.53 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2712  ATP12 ATPase  44.3 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3127  ATP12 ATPase  38.52 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.922755  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2504  ATP12 ATPase  42.49 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2337  ATP12 ATPase  38.78 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0422337  normal  0.128949 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0792  ATP12 ATPase  42.86 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0490  ATP12 ATPase  44.02 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332583 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0731  ATP12 chaperone family protein  37.61 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0222594  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3401  ATP12 ATPase  40.76 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0153972  normal  0.0790804 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1576  ATP12 ATPase  40.76 
 
 		 260 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190684  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3622  ATP12 ATPase  41.52 
 
 		 261 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1314  ATP12 ATPase  39.84 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4761  ATP12 ATPase  46.09 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0853  ATP12 ATPase  41.23 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.344242  decreased coverage  0.000239957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1398  chaperone required for the assembly of F1-ATPase  39.15 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00511954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0293  ATP12 ATPase  40.93 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.553386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1647  ATP12 ATPase  40.64 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.306499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5031  hypothetical protein  39.17 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2681  ATP12 ATPase  44.98 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2841  ATP12 ATPase  40.85 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0834474  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2104  ATP12 ATPase  40.35 
 
 		 229 aa  135  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2101  ATP12 ATPase  41.36 
 
 		 291 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03060  hypothetical protein  36.02 
 
 		 292 aa  129  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43255  predicted protein  35.75 
 
 		 245 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.917305 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50559  predicted protein  29.19 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09062  mitochondrial molecular chaperone (Atp12), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02490)  23.67 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.488866  normal  0.0529685 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56516  F1-ATP synthase assembly protein  24.41 
 
 		 301 aa  46.2  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.471375  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>