45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2841 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2841  ATP12 ATPase  100 
 
 
230 aa  454  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0834474  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2712  ATP12 ATPase  48.25 
 
 
230 aa  192  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0293  ATP12 ATPase  43.42 
 
 
234 aa  170  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.553386  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2084  ATP12 ATPase  41.26 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124056  normal  0.330862 
 
 
-
 
NC_004310  BR1003  hypothetical protein  40 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1882  ATP12 ATPase  40.99 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0827011  normal  0.0218555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1017  ATP12 ATPase  42.73 
 
 
261 aa  161  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.388944  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2086  ATP12 ATPase  39.29 
 
 
260 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0969  hypothetical protein  39.56 
 
 
234 aa  159  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0392  ATP12 ATPase  41.67 
 
 
235 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.647133  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1746  hypothetical protein  40.79 
 
 
235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2504  ATP12 ATPase  42.98 
 
 
235 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0281  ATP12 ATPase  40.71 
 
 
267 aa  151  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0324  ATP12 ATPase  40.71 
 
 
267 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2770  ATP12 ATPase  42.11 
 
 
271 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77249  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0357  ATP12 ATPase  40.71 
 
 
267 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2656  ATP12 ATPase  40.09 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.924505  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0317  ATP12 chaperone protein  39.52 
 
 
234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7121  ATP12 ATPase  41.23 
 
 
262 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5031  hypothetical protein  39.73 
 
 
260 aa  141  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0626  ATP12 ATPase  41.09 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0731  ATP12 chaperone family protein  36.61 
 
 
261 aa  137  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0222594  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0792  ATP12 ATPase  38.86 
 
 
236 aa  135  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169116  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2263  hypothetical protein  36.28 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6370  ATP12 ATPase  37.28 
 
 
262 aa  134  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1398  chaperone required for the assembly of F1-ATPase  36.49 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00511954  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2104  ATP12 ATPase  41.23 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3127  ATP12 ATPase  35.9 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.922755  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1314  ATP12 ATPase  38.03 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1759  ATP12 ATPase  36.19 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.354335  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3622  ATP12 ATPase  40.2 
 
 
261 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2681  ATP12 ATPase  41.38 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3401  ATP12 ATPase  35.78 
 
 
261 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0153972  normal  0.0790804 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1576  ATP12 ATPase  33.94 
 
 
260 aa  125  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0853  ATP12 ATPase  37.78 
 
 
263 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.344242  decreased coverage  0.000239957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2337  ATP12 ATPase  35.84 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0422337  normal  0.128949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1647  ATP12 ATPase  38.05 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.306499  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1704  ATP12 ATPase  37.83 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0490  ATP12 ATPase  35.48 
 
 
246 aa  99.8  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332583 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4761  ATP12 ATPase  38.77 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2101  ATP12 ATPase  35.98 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43255  predicted protein  34.78 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.917305 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03060  hypothetical protein  28.26 
 
 
292 aa  79  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50559  predicted protein  28.3 
 
 
390 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09062  mitochondrial molecular chaperone (Atp12), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02490)  24.71 
 
 
369 aa  51.6  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.488866  normal  0.0529685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>