21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2351 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2351  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.346428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0165  hypothetical protein  76.92 
 
 		 65 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2412  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  83.6  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1970  hypothetical protein  54.29 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4550  hypothetical protein  52.46 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1930  hypothetical protein  66.67 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0186  hypothetical protein  46.27 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1441  hemin transport system, hemin uptake protein  47.27 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1605  hypothetical protein  48.98 
 
 		 54 aa  47  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000330162  hitchhiker  0.0000142519 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1508  hypothetical protein  55.56 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.265609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3017  hemin transport system, hemin uptake protein  43.08 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2337  hemin uptake protein-like protein  46.55 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1687  hypothetical protein  55.56 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3622  hypothetical protein  58.82 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3268  hemin transport system, hemin uptake protein  41.54 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202913  hitchhiker  0.00689409 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1789  hypothetical protein  55.56 
 
 		 41 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00105289  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0725  hypothetical protein  58.33 
 
 		 60 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.681325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0386  hypothetical protein  43.4 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3132  hypothetical protein  69.23 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10143  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1568  hypothetical protein  54.05 
 
 		 48 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.652462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4587  hypothetical protein  43.4 
 
 		 70 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.267053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>