40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1528 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
168 aa  344  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.852993  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1022  GCN5-related N-acetyltransferase  84.91 
 
 
159 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288389  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  75.47 
 
 
159 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2096  GCN5-related N-acetyltransferase  46.9 
 
 
148 aa  141  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2077  GCN5-related N-acetyltransferase  42.48 
 
 
155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221334  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2813  GCN5-related N-acetyltransferase  44.14 
 
 
146 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1441  GCN5-related N-acetyltransferase  42.76 
 
 
146 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2946  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0988  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
188 aa  57.8  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803584  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0274  hypothetical protein  30 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000464139  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  26.39 
 
 
318 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258255  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4336  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  26.92 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2945  GCN5-related N-acetyltransferase  25.69 
 
 
181 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3698  GCN5-related N-acetyltransferase  35.64 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  31.31 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8442  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0521175 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.55 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  25.19 
 
 
213 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.268163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.67 
 
 
162 aa  44.7  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3344  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 
205 aa  44.7  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.47 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0374  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
155 aa  44.3  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.918937  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0266  acetyltransferase-like  26.81 
 
 
223 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.879023  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 
139 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0233135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2815  acetyltransferase, GNAT family  27.01 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0593  putative acetyltransferase  34.29 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.623078  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1061  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.21 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1086  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
170 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1420  hypothetical protein  30.68 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.397354  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0119  acetyltransferase  26.97 
 
 
152 aa  42.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  31 
 
 
151 aa  42  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2955  putative acetyltransferase  28.57 
 
 
162 aa  41.6  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1771  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  21.37 
 
 
173 aa  41.6  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  21.68 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1406  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.38 
 
 
170 aa  40.8  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.964873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1638  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 
178 aa  40.8  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0766  GCN5-related N-acetyltransferase  21.57 
 
 
147 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>