19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4598 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4598  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3868  hypothetical protein  52.32 
 
 		 232 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.407065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  53.59 
 
 		 241 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1439  hypothetical protein  49.8 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  34.66 
 
 		 327 aa  93.6  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3879  hypothetical protein  32.9 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  32.97 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2382  hypothetical protein  30.74 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374841  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1044  hypothetical protein  30.39 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5259  nutrient deprivation-induced protein  29.02 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3871  late embryogenesis abundant protein  31.14 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.396289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1245  late embryogenesis abundant protein  33.74 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  28.82 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4200  hypothetical protein  34.33 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00749597  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5622  nutrient deprivation-induced protein  29.23 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.227691 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3143  hypothetical protein  26.32 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4601  late embryogenesis abundant protein  28.23 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6818  hypothetical protein  33.98 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4346  hypothetical protein  26.67 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>