More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4564 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  100 
 
 		 340 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2191  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  60.79 
 
 		 344 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1219  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.23 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.7 
 
 		 345 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3898  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.93 
 
 		 350 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_004310  BR0958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.38 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.105392  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.68 
 
 		 345 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0948  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.38 
 
 		 344 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.66 
 
 		 344 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.27 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292381  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.29 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.36 
 
 		 344 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.45 
 
 		 340 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1558  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.76 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.15 
 
 		 345 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1785  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  54.71 
 
 		 351 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.54 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420701  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  53.89 
 
 		 349 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.62 
 
 		 344 aa  363  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2650  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.62 
 
 		 344 aa  362  4e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1387  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  54.08 
 
 		 351 aa  362  4e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.32 
 
 		 344 aa  361  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00282433  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.67 
 
 		 329 aa  359  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2122  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.84 
 
 		 340 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.23 
 
 		 346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.5 
 
 		 348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  54.49 
 
 		 339 aa  355  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187872  normal  0.347401 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2247  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.19 
 
 		 348 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2254  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.06 
 
 		 344 aa  354  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1878  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  54.24 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0061453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0235  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  54.24 
 
 		 344 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  54.57 
 
 		 348 aa  353  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  51.96 
 
 		 335 aa  343  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3287  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  51.6 
 
 		 345 aa  342  5e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1879  molybdenum cofactor synthesis-like  54.27 
 
 		 354 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1055  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  54.49 
 
 		 347 aa  341  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0726639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1290  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  51.96 
 
 		 336 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0333256  normal  0.347849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5676  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.62 
 
 		 340 aa  333  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.24 
 
 		 342 aa  325  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2711  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  50.6 
 
 		 339 aa  318  7e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.122417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0325  molybdenum cofactor biosynthesis protein  52.57 
 
 		 335 aa  318  9e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  51.5 
 
 		 339 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0124  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.31 
 
 		 338 aa  308  5.9999999999999995e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.592578  normal  0.0245829 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1605  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  50.91 
 
 		 331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.8 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1288  molybdenum cofactor synthesis protein  48.79 
 
 		 330 aa  298  7e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.94 
 
 		 329 aa  298  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  0.121323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1239  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.64 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3777  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  52.42 
 
 		 338 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.579463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3050  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  52.42 
 
 		 338 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0518  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  47.6 
 
 		 365 aa  291  8e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2294  molybdenum cofactor synthesis-like protein  47.88 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.819438  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.02 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.1 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2766  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.74 
 
 		 331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237766  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1520  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  47.9 
 
 		 346 aa  272  8.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.886892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44970  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.02 
 
 		 331 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3826  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.02 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1655  molybdenum cofactor synthesis-like protein  45.73 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1999  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  43.24 
 
 		 357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3388  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.67 
 
 		 332 aa  265  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.64 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3906  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.58 
 
 		 334 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.2 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2357  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  40.66 
 
 		 331 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.719976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.6 
 
 		 327 aa  259  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2516  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.77 
 
 		 332 aa  258  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0514833  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  43.2 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4597  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.67 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1291  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.67 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4127  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.98 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.47 
 
 		 332 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0620358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4267  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.3 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.3 
 
 		 327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.3 
 
 		 328 aa  252  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4462  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.3 
 
 		 327 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1949  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.81 
 
 		 343 aa  251  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  41.69 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40 
 
 		 328 aa  249  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0460197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.87 
 
 		 328 aa  248  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30330  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.71 
 
 		 331 aa  248  8e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3884  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.7 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.7 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  42.12 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  41 
 
 		 329 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0077  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.39 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3879  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.7 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.7 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1315  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.36 
 
 		 341 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.81 
 
 		 328 aa  245  6e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3972  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.39 
 
 		 327 aa  245  8e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.39 
 
 		 327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4099  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.21 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1023  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  42.6 
 
 		 327 aa  239  5e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165145 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0158  molybdenum cofactor synthesis-like  41.96 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.68 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.14 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1683  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.17 
 
 		 327 aa  232  7.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.58 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.26 
 
 		 323 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>