14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4517 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4517    100 
 
 		 294 bp  583  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  92 
 
 		 1500 bp  168  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  92 
 
 		 1500 bp  168  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  88.46 
 
 		 1491 bp  139  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  86.05 
 
 		 1500 bp  113  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  86.05 
 
 		 1500 bp  113  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  86.05 
 
 		 1500 bp  113  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  85.27 
 
 		 1500 bp  105  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  85.27 
 
 		 1500 bp  105  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1204    85.04 
 
 		 432 bp  101  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4095    84.25 
 
 		 474 bp  93.7  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  82.68 
 
 		 1500 bp  77.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1107    94.29 
 
 		 1499 bp  54  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  85.45 
 
 		 1548 bp  46.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>