12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4095 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4095    100 
 
 		 474 bp  940    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  85.89 
 
 		 1500 bp  274  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  85.89 
 
 		 1500 bp  274  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  85.89 
 
 		 1500 bp  274  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  85.3 
 
 		 1500 bp  256  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  85.3 
 
 		 1500 bp  256  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  85.06 
 
 		 1500 bp  208  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  85.06 
 
 		 1500 bp  208  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  83.39 
 
 		 1500 bp  208  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1204    87.34 
 
 		 432 bp  155  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  80.28 
 
 		 1491 bp  119  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4517    84.25 
 
 		 294 bp  93.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>