177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4323 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_4323  putative acetyltransferase  100 
 
 
148 aa  300  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2385  putative acetyltransferase  68.92 
 
 
151 aa  216  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.110426  normal  0.478401 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3264  putative acetyltransferase  51.75 
 
 
150 aa  156  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172457  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2169  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0666811  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  50.74 
 
 
155 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.633559 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28630  acetyltransferase  46.67 
 
 
154 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319121  normal  0.0687549 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0549  putative acetyltransferase  48 
 
 
141 aa  121  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  50.41 
 
 
139 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2840  GCN5-related N-acetyltransferase  44.68 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000815597  normal  0.0271739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2466  GCN5-related N-acetyltransferase  49.59 
 
 
143 aa  110  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0154412 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2683  GCN5-related N-acetyltransferase  39.26 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.909904  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3052  putative acetyltransferase  41.55 
 
 
146 aa  108  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  42.65 
 
 
138 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  43.9 
 
 
139 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.631639  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1588  GCN5-related N-acetyltransferase  39.42 
 
 
139 aa  104  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3462  putative acetyltransferase  39.26 
 
 
141 aa  104  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1281  putative acetyltransferase  39.26 
 
 
141 aa  103  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2783  putative acetyltransferase  39.26 
 
 
141 aa  103  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1394  putative acetyltransferase  39.26 
 
 
141 aa  103  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.507407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2955  putative acetyltransferase  37.41 
 
 
162 aa  103  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2685  putative acetyltransferase  38.52 
 
 
141 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.440261  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2643  putative acetyltransferase  38.52 
 
 
141 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2815  putative acetyltransferase  38.52 
 
 
141 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.438827  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2594  putative acetyltransferase  38.52 
 
 
141 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2709  putative acetyltransferase  38.52 
 
 
141 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3289  putative acetyltransferase  37.04 
 
 
141 aa  100  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.834546  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3210  putative acetyltransferase  38.52 
 
 
141 aa  98.6  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2806  putative acetyltransferase  37.78 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02334  putative acetyltransferase  37.78 
 
 
141 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02296  hypothetical protein  37.78 
 
 
141 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3664  putative acetyltransferase  37.78 
 
 
141 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.863704  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2571  putative acetyltransferase  37.78 
 
 
141 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2720  putative acetyltransferase  37.78 
 
 
141 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2589  putative acetyltransferase  37.78 
 
 
141 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1227  GCN5-related N-acetyltransferase  37.78 
 
 
141 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0994  putative acetyltransferase  40.48 
 
 
145 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1245  putative acetyltransferase  37.78 
 
 
141 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.756848 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0758  putative acetyltransferase  37.5 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0826  putative acetyltransferase  36.57 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3573  acetyltransferase, GNAT family  38.69 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214291  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3140  putative acetyltransferase  35.82 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0451024  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535173  normal  0.634598 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2410  putative acetyltransferase  33.1 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12020  N-acetyltransferase (GNAT) family  37.82 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536123  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2196  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000283618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1968  putative acetyltransferase  34.97 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000689442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1149  putative acetyltransferase  34.97 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0150851  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0790  putative acetyltransferase  33.57 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0988  putative acetyltransferase  34.97 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000423177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0995  putative acetyltransferase  34.97 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0756799  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0268  putative acetyltransferase  34.97 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0945  putative acetyltransferase  34.97 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0880  putative acetyltransferase  34.97 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000172185  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1881  putative acetyltransferase  32.41 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2492  putative acetyltransferase  32.41 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2517  putative acetyltransferase  32.41 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0593  putative acetyltransferase  31.29 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.623078  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2539  putative acetyltransferase  33.09 
 
 
155 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5824  putative acetyltransferase  31.03 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.141367 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003177  acetyltransferase  32.79 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0803  putative acetyltransferase  31.03 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.711368 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0035  acetyltransferase  30.4 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00435324  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2174  acetyltransferase  29.37 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00703282  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22510  Acetyltransferase, GNAT family  36.07 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.919154  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16600  N-acetylglutamate synthase  38.36 
 
 
155 aa  53.5  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0802  putative acetyltransferase  29.41 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2724  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.33727  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0451  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  36.22 
 
 
295 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.237261  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000199537  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0440  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37660  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  42.11 
 
 
306 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3429  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  37.7 
 
 
297 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4093  GCN5-related N-acetyltransferase  36.62 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0491  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  25.19 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58830  hypothetical protein  28.33 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.144795 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3230  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.19 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0019  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.41 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0323693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2531  GCN5-related N-acetyltransferase  30.33 
 
 
291 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.801418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5170  hypothetical protein  29.17 
 
 
141 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592024  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3522  GCN5-related N-acetyltransferase  36.62 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.175293 
 
 
-
 
NC_002936  DET1149  acetyltransferase  26.24 
 
 
164 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0436  acetyltransferase  27.92 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  37.33 
 
 
369 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8254  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  33.65 
 
 
314 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1990  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.12 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0465  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.96 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.84 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1843  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.12 
 
 
164 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00686227  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0574  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
368 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0841815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2515  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.39 
 
 
378 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.291701  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0276  acetyltransferase  26.56 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.59 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129008  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1781  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
169 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3544  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  32 
 
 
292 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3011  GCN5-related N-acetyltransferase  30.85 
 
 
257 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0250  acetyltransferase  26.92 
 
 
148 aa  44.3  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11650  sortase-like acyltransferase  30.07 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.359043  normal  0.185087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3585  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.64 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  34.34 
 
 
176 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  26.09 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>