21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1320 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1320  photosynthetic complex assembly protein  100 
 
 		 220 aa  443  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562837  normal  0.156317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1737  putative photosynthetic complex assembly protein  62.73 
 
 		 220 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3729  putative photosynthetic complex assembly protein  60.91 
 
 		 220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00156993  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3974  photosynthetic complex assembly protein  60.91 
 
 		 220 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728012  normal  0.262812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0616  photosynthetic complex assembly protein  41.43 
 
 		 224 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17866  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2035  photosynthetic complex assembly protein  39.5 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4809  putative photosynthetic complex assembly protein  44.06 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6410  hypothetical protein  41.71 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1630  hypothetical protein  37.19 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5276  putative photosynthetic complex assembly protein  43.63 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5354  putative photosynthetic complex assembly protein  41.3 
 
 		 227 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.457563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3725  putative photosynthetic complex assembly protein  42.86 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1841  putative photosynthetic complex assembly protein  42.44 
 
 		 216 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0719719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0154  photosynthetic complex assembly protein  37.78 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3541  putative photosynthetic complex assembly protein  37.64 
 
 		 225 aa  118  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1935  hypothetical protein  35 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0292  hypothetical protein  33.89 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1003  hypothetical protein  33.7 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  26.89 
 
 		 176 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  26.27 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  27.05 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>