20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0411 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0411  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3953  hypothetical protein  60.53 
 
 		 78 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139269  normal  0.667316 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1891  hypothetical protein  55.26 
 
 		 79 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.252945  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1590  hypothetical protein  46.91 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.148818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0529  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  83.6  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.911072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2905  hypothetical protein  34.67 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1026  hypothetical protein  38.1 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2687  hypothetical protein  37.7 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383276  normal  0.520608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2707  hypothetical protein  30.99 
 
 		 94 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1657  hypothetical protein  30.99 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681097  hitchhiker  0.000000408303 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2808  hypothetical protein  30.99 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.198035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1237  hypothetical protein  28.24 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2729  hypothetical protein  30.99 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00123009  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2410  hypothetical protein  31.34 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4371  hypothetical protein  31.94 
 
 		 78 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455488  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1511  hypothetical protein  30.56 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.503038  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3029  hypothetical protein  29.17 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0888  hypothetical protein  31.58 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1521  hypothetical protein  30.56 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0911335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1455  hypothetical protein  30.56 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>