56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4544 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4544  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25009  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0859  hypothetical protein  85.71 
 
 		 217 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0941  protein of unknown function DUF1007  76.96 
 
 		 217 aa  362  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049615  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4840  hypothetical protein  73.3 
 
 		 235 aa  321  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1352  hypothetical protein  69.74 
 
 		 211 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.361884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2906  hypothetical protein  51.4 
 
 		 214 aa  228  7e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0392  hypothetical protein  47 
 
 		 216 aa  191  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0855106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0278  protein of unknown function DUF1007  42.01 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  43.26 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2332  hypothetical protein  42.93 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0375324  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1679  protein of unknown function DUF1007  42.79 
 
 		 225 aa  153  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355728  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5736  protein of unknown function DUF1007  38.58 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0082  hypothetical protein  39.22 
 
 		 243 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1399  protein of unknown function DUF1007  40.61 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0330358  normal  0.0597647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2246  hypothetical protein  42.13 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1783  protein of unknown function DUF1007  35.53 
 
 		 211 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2203  hypothetical protein  31.4 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0980814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1043  protein of unknown function DUF1007  35.57 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0089  hypothetical protein  30.48 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0097  hypothetical protein  30.48 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2712  hypothetical protein  29.58 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4248  hypothetical protein  29.44 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2975  protein of unknown function DUF1007  31.28 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2375  protein of unknown function DUF1007  29.49 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18361 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3392  protein of unknown function DUF1007  28.44 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3809  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  88.6  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1660  hypothetical protein  32.93 
 
 		 232 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0619256  normal  0.666853 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0752  protein of unknown function DUF1007  26.99 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000375765  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3632  hypothetical protein  29.82 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2774  hypothetical protein  26.39 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1754  hypothetical protein  28.78 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1163  hypothetical protein  27.55 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000035271  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0440  hypothetical protein  27.55 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000354485  hitchhiker  0.00000494731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1271  hypothetical protein  27.55 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00860281  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1975  putative lipoprotein  27.84 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3032  hypothetical protein  27.75 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.199492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1095  protein of unknown function DUF1007  27.8 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3679  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  29.71 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.928215  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3691  protein of unknown function DUF1007  25.52 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366003  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0115  hypothetical protein  24.31 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0287107  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  30.97 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1594  polyphosphate kinase  27.87 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4269  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  27.84 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.655735 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1233  protein of unknown function DUF1007  25.64 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3209  hypothetical protein  22.05 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0833  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component related protein  29.05 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279263  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2760  protein of unknown function DUF1007  26.76 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3042  hypothetical protein  24.74 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0675  protein of unknown function DUF1007  26.13 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.019732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2927  hypothetical protein  26.05 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2707  hypothetical protein  26.05 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874677  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2814  hypothetical protein  26.05 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2752  hypothetical protein  26.05 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2793  hypothetical protein  25.82 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1928  hypothetical protein  23.7 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1080  hypothetical protein  23.62 
 
 		 213 aa  45.1  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>