12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1618 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1618  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1830  hypothetical protein  68.57 
 
 		 250 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0164  hypothetical protein  66.82 
 
 		 234 aa  290  8e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2379  hypothetical protein  63.98 
 
 		 251 aa  268  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2464  hypothetical protein  62.26 
 
 		 251 aa  263  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2686  hypothetical protein  62.26 
 
 		 251 aa  263  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4911  hypothetical protein  61.35 
 
 		 251 aa  262  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2566  hypothetical protein  61.14 
 
 		 255 aa  259  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0265938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3044  hypothetical protein  58.14 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3248  hypothetical protein  52.83 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01231  hypothetical protein  46.53 
 
 		 209 aa  188  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.959365  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0917  hypothetical protein  45.33 
 
 		 222 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>