18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3489 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3489  FlgN  100 
 
 		 155 aa  304  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459728  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1924  hypothetical protein  92.26 
 
 		 155 aa  286  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.254408  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4256  FlgN  60 
 
 		 155 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3957  FlgN family protein  55.48 
 
 		 155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4396  FlgN family protein  54.84 
 
 		 155 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1458  FlgN family protein  53.55 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3737  FlgN family protein  50.97 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2855  FlgN family protein  50.97 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451299  normal  0.245118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1778  hypothetical protein  44.23 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20720  hypothetical protein  42.31 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1212  FlgN family protein  31.85 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.783285  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0921  FlgN family protein  28.91 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4794  FlgN family protein  29.86 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.295932 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3717  FlgN family protein  29.86 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.280332  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3974  hypothetical protein  29.32 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0339  flagella synthesis protein FLGN  29.86 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0304  hypothetical protein  28.72 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3471  hypothetical protein  28.35 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.370785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>