35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1582 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3903  hypothetical protein  95.21 
 
 		 356 aa  694    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1582  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  726    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422595  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1412  hypothetical protein  77.68 
 
 		 358 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4572  hypothetical protein  74.57 
 
 		 357 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1317  hypothetical protein  73.71 
 
 		 357 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4093  hypothetical protein  73.43 
 
 		 357 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3872  hypothetical protein  73.14 
 
 		 357 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29120  hypothetical protein  68.54 
 
 		 361 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3985  hypothetical protein  67.99 
 
 		 361 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1789  hypothetical protein  64.39 
 
 		 364 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1600  hypothetical protein  40.06 
 
 		 357 aa  266  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.867208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3749  hypothetical protein  40.3 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03982  hypothetical protein  33.05 
 
 		 369 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.47471  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4190  hypothetical protein  35.29 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12788  hypothetical protein  29.88 
 
 		 401 aa  179  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.405764  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5355  hypothetical protein  30.46 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2262  hypothetical protein  29.55 
 
 		 413 aa  169  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4139  hypothetical protein  26.76 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0375  hypothetical protein  27.59 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0193  hypothetical protein  23.99 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0142  hypothetical protein  33.33 
 
 		 541 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0125  hypothetical protein  33.68 
 
 		 541 aa  109  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1794  hypothetical protein  23.14 
 
 		 385 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1873  hypothetical protein  22.86 
 
 		 385 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146136  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2083  hypothetical protein  22.57 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1745  hypothetical protein  21.38 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.886322  normal  0.285515 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2712  hypothetical protein  22.63 
 
 		 595 aa  49.3  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1259  hypothetical protein  23.31 
 
 		 996 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0273  hypothetical protein  25 
 
 		 1098 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1599  hypothetical protein  19.25 
 
 		 1124 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2055  hypothetical protein  23.22 
 
 		 587 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.429866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3599  hypothetical protein  19.65 
 
 		 960 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4569  hypothetical protein  21.66 
 
 		 978 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4704  hypothetical protein  21.66 
 
 		 978 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542548  hitchhiker  0.00128014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4482  hypothetical protein  20.51 
 
 		 1002 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>