15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1512 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1512  prepilin  100 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59320  type IV B pilus protein  50.29 
 
 		 176 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00129697  hitchhiker  0.00000000000539359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4476  type IV B pilus protein  50.29 
 
 		 176 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0019  type IV prepilin domain-containing protein PilS  37.34 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3729  type IV pilus biogenesis protein  31.87 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1605  putative type IV pilus biogenesis protein  31.87 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0158393  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0651  putative major pilin subunit  31.87 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1984  putative type IV pilus biogenesis protein  31.87 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2252  putative type IV pilus protein  31.87 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2168  putative type IV pilus protein  31.87 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00445151  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0663  putative type IV pilus biogenesis protein  31.87 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.655002  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0065  putative type IV secretion system protein PilS2  30.83 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0112  typeIV prepilin  31.62 
 
 		 204 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0774  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.81 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406536  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5914  PilS domain-containing protein  33.73 
 
 		 202 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.353424  hitchhiker  0.00844308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>