20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0982 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0982  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1142  hypothetical protein  91.86 
 
 		 86 aa  155  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0991751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4717  hypothetical protein  67.44 
 
 		 86 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.813959  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4431  hypothetical protein  62.79 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3671  hypothetical protein  63.95 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0799  hypothetical protein  61.63 
 
 		 86 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0785  hypothetical protein  62.79 
 
 		 86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61340  hypothetical protein  58.62 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.422961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5282  hypothetical protein  58.62 
 
 		 87 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.587744  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1068  hypothetical protein  41.67 
 
 		 264 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.697247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0683  hypothetical protein  37.31 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.740334  normal  0.446844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1439  hypothetical protein  40.62 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0106518  hitchhiker  0.00000448294 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1386  hypothetical protein  40.62 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136408  hitchhiker  0.000000182835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2164  hypothetical protein  35.29 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1451  hypothetical protein  40.62 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185843  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04607  hypothetical protein  38.1 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1760  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0207177  normal  0.0104849 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3109  hypothetical protein  39.06 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2333  hypothetical protein  42.19 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.101218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1474  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0666349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>