31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0866 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0866  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  783    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.896574  normal  0.759302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1620  hypothetical protein  93.85 
 
 		 374 aa  741    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2356  hypothetical protein  85.37 
 
 		 368 aa  669    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2726  hypothetical protein  51.25 
 
 		 331 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0204  GP47  50.3 
 
 		 331 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0110  hypothetical protein  51.56 
 
 		 358 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1183  Phage-related protein endonuclease-like protein  50.45 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4743  phage-related protein endonuclease-like protein  51.21 
 
 		 334 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2448  hypothetical protein  48.94 
 
 		 342 aa  323  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2495  hypothetical protein  48.96 
 
 		 334 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1657  hypothetical protein  50.62 
 
 		 342 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3684  hypothetical protein  50.33 
 
 		 300 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1473  Phage-related protein endonuclease-like protein  39.62 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0602  phage-type endonuclease  39.05 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2619  YqaJ  39.32 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2263  hypothetical protein  35.19 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00963472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0938  hypothetical protein  36.18 
 
 		 303 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1345  Phage-related protein endonuclease-like protein  31.52 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000265319  decreased coverage  0.000101887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0982  hypothetical protein  31.53 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000285055  hitchhiker  0.0000282178 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3739  putative phage-related protein  31.33 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00326083  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0602  phage-type endonuclease  40.53 
 
 		 247 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3414  Phage-related protein endonuclease-like protein  34.25 
 
 		 303 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0329559 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0373  Phage-related protein endonuclease-like protein  54.08 
 
 		 136 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2700  Phage-related protein endonuclease-like  27.95 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1286  hypothetical protein  32.45 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0110  putative phage-type endonuclease  28.85 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.300181 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0099  hypothetical protein  29.13 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344559  hitchhiker  0.000179281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2639  phage-related protein endonuclease-like protein  25.53 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3585  hypothetical protein  23.63 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6282  phage-related protein endonuclease-like protein  24.79 
 
 		 316 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.43147  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4068  Phage-related protein endonuclease-like  23.53 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>