25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1205 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1120  hypothetical protein  76.59 
 
 		 524 aa  694    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1298  GTP-binding protein, HSR1-related  78.1 
 
 		 538 aa  713    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1205  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 520 aa  1057    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3494  GTP-binding protein, HSR1-related  39.08 
 
 		 464 aa  306  6e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393129 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4735  GTP-binding protein, HSR1-related  43.47 
 
 		 462 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0331  GTP-binding protein HSR1-related  43.5 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5134  hypothetical protein  43.33 
 
 		 456 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5007  GTP-binding protein, HSR1-related  43.5 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48140  HSR1-related GTP-binding protein  41.74 
 
 		 447 aa  259  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5186  GTP-binding protein HSR1-related  42.83 
 
 		 454 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4212  GTP-binding protein, HSR1-related  44.54 
 
 		 455 aa  257  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0439  hypothetical protein  43.47 
 
 		 462 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4059  GTP-binding protein HSR1-related  36.97 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5363  GTP-binding protein, HSR1-like  43.44 
 
 		 461 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04510  hypothetical protein  43.14 
 
 		 459 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0437  hypothetical protein  42.63 
 
 		 458 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0511  GTP-binding protein HSR1-related  39.91 
 
 		 462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.886281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0149  hypothetical protein  42.38 
 
 		 462 aa  231  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3226  GTP-binding protein HSR1-related  34.74 
 
 		 473 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0950  GTP-binding protein, HSR1-related  25.28 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.892175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0080  hypothetical protein  25.42 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2941  GTP-binding protein HSR1-related  28 
 
 		 508 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.781995 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0660  GTP-binding protein HSR1-related  24.86 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1450  GTP-binding protein HSR1-related  23.06 
 
 		 474 aa  54.3  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1439  hypothetical protein  28.16 
 
 		 514 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>