16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0050 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0050  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  223  9e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0048  hypothetical protein  84.62 
 
 		 107 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0040  hypothetical protein  84.62 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.79338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1521  hypothetical protein  30.86 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6321  hypothetical protein  35.71 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3237  hypothetical protein  36.14 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  36.14 
 
 		 105 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0722  hypothetical protein  32.1 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1816  hypothetical protein  36.25 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1125  hypothetical protein  28.4 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.335532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3022  hypothetical protein  36.62 
 
 		 114 aa  43.5  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0578  hypothetical protein  36.36 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1224  hypothetical protein  30.95 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.654135  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1272  chaperone-modulator protein CbpM  30.95 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1427  MerR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1430  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>