13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4834 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4961  putative lipoprotein  100 
 
 		 109 aa  223  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4834  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  223  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5010  lipoprotein  99.08 
 
 		 109 aa  222  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0505  lipoprotein  86.24 
 
 		 109 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5263  putative lipoprotein  77.06 
 
 		 110 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0461  hypothetical protein  74.71 
 
 		 108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4788  putative lipoprotein  60.55 
 
 		 108 aa  135  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0994885 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0389  lipoprotein, putative  59.63 
 
 		 108 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_07210  hypothetical protein  53.33 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0657  hypothetical protein  56.79 
 
 		 113 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1771  putative lipoprotein  32.26 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0555699  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A2556  putative lipoprotein  32.26 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0857422  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_1879  hypothetical protein  32.26 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116549  n/a   
 
 
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