10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4788 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4788  putative lipoprotein  100 
 
 		 108 aa  222  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0994885 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0389  lipoprotein, putative  97.22 
 
 		 108 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4961  putative lipoprotein  60.55 
 
 		 109 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4834  hypothetical protein  60.55 
 
 		 109 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5263  putative lipoprotein  60.36 
 
 		 110 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5010  lipoprotein  59.63 
 
 		 109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0505  lipoprotein  57.8 
 
 		 109 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0461  hypothetical protein  58.43 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07210  hypothetical protein  51.06 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0657  hypothetical protein  51.06 
 
 		 113 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
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