11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0461 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0461  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  221  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5010  lipoprotein  68.87 
 
 		 109 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4961  putative lipoprotein  68.87 
 
 		 109 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4834  hypothetical protein  68.87 
 
 		 109 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0505  lipoprotein  66.98 
 
 		 109 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5263  putative lipoprotein  60 
 
 		 110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0389  lipoprotein, putative  55.56 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4788  putative lipoprotein  55.56 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0994885 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07210  hypothetical protein  58.06 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0657  hypothetical protein  58.06 
 
 		 113 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2709  hypothetical protein  38.71 
 
 		 116 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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