20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2839 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2839  phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X region  100 
 
 		 822 aa  1703    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0819  phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X region  30.97 
 
 		 315 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2347  phosphatidylinositol-specific phospholipase C X region  25.29 
 
 		 471 aa  62  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.152355  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06382  conserved hypothetical protein  22.26 
 
 		 630 aa  60.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.199255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1713  1-phosphatidylinositol phosphodiesterase (Phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase) (Phosphatidylinositol-specific phospholipase C) (PI-PLC)  24.4 
 
 		 471 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000119858 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0795  hypothetical protein  29.92 
 
 		 608 aa  55.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05780  expressed protein  29.57 
 
 		 430 aa  54.7  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.490409  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3757  Phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  30.63 
 
 		 297 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325914  normal  0.37365 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48445  predicted protein  27.64 
 
 		 489 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5471  Phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  27.27 
 
 		 325 aa  51.6  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.427278  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70308  predicted protein  28.23 
 
 		 297 aa  50.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.80881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4154  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  26.9 
 
 		 306 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3596  phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X region  28.81 
 
 		 306 aa  48.9  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.309505  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4771  phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X region  29.31 
 
 		 297 aa  48.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4678  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  26.32 
 
 		 306 aa  48.1  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.424256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1585  hypothetical protein  29.7 
 
 		 282 aa  47.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27067  predicted protein  34.21 
 
 		 334 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0336284  hitchhiker  0.0000242451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2642  hypothetical protein  29.85 
 
 		 279 aa  46.6  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6736  phosphatidylinositol-specific phospholipase C X region  28.21 
 
 		 320 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal  0.957672 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07970  conserved hypothetical protein  30.3 
 
 		 493 aa  44.3  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100095  normal  0.162889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>