31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1585 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1585  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  590  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5471  Phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  23.49 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.427278  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6736  phosphatidylinositol-specific phospholipase C X region  29.25 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1713  1-phosphatidylinositol phosphodiesterase (Phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase) (Phosphatidylinositol-specific phospholipase C) (PI-PLC)  27.08 
 
 
471 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000119858 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2347  phosphatidylinositol-specific phospholipase C X region  27.63 
 
 
471 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.152355  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3757  Phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  25.09 
 
 
297 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325914  normal  0.37365 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3793  1-phosphatidylinositol phosphodiesterase  26.74 
 
 
329 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00985901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1438  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  26.8 
 
 
326 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00194348  hitchhiker  0.00010452 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3513  glycosylphosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  26.13 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3860  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  27.15 
 
 
329 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.133194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3801  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  26.13 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000171037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3501  glycosylphosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  26.55 
 
 
329 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000999913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3891  1-phosphatidylinositol phosphodiesterase  26.55 
 
 
329 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3771  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  26.55 
 
 
329 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000319022 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3604  1-phosphatidylinositol phosphodiesterase  26.55 
 
 
329 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00660828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3532  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  26.46 
 
 
329 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03636  phosphatidylinositol phospholipase C (AFU_orthologue; AFUA_4G12000)  28.08 
 
 
485 aa  60.1  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0086  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  21.85 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0083  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  21.85 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4678  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  25 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.424256  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4154  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  25 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0943  phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X region  25 
 
 
291 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48445  predicted protein  28.93 
 
 
489 aa  52.8  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70308  predicted protein  24.19 
 
 
297 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.80881  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5512  phosphatidylinositol-specific phospholipase C X region  29.21 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.053033  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4771  phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X region  25 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3596  phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X region  25 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.309505  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2839  phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X region  28.44 
 
 
822 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06382  conserved hypothetical protein  25.66 
 
 
630 aa  46.6  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.199255  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0819  phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X region  24.75 
 
 
315 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2642  hypothetical protein  25 
 
 
279 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>