36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2493 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2493  peptidase S14, ClpP  100 
 
 		 183 aa  383  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3267  Clp protease, putative  98.36 
 
 		 198 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2629  peptidase S14 ClpP  92.9 
 
 		 183 aa  362  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.358481 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2643  peptidase S14 ClpP  84.7 
 
 		 183 aa  334  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00556113  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3110  hypothetical protein  77.9 
 
 		 184 aa  307  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00654762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36350  hypothetical protein  75.69 
 
 		 184 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0193577  normal  0.867285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2263  peptidase S14, ClpP  65.38 
 
 		 183 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168754  normal  0.0339851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02290  clp protease  68.31 
 
 		 142 aa  212  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3078  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.25 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25250  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  31.03 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0560465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6060  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.16 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28390  protease subunit of ATP-dependent protease  29.93 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10817 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0787  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.33 
 
 		 203 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2052  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.74 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.913784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.29 
 
 		 218 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1531  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  27.45 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.307133  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.71 
 
 		 195 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.71 
 
 		 195 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.71 
 
 		 195 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2790  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.27 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  28.44 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0480  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.27 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  25.16 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0784  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.57 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4515  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  26.92 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010245  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0954  peptidase S14 ClpP  22.22 
 
 		 355 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  26.28 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4040  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.71 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2151  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.27 
 
 		 200 aa  42  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  23.97 
 
 		 260 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0489  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.87 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.650112 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0389  peptidase S14, ClpP  27.07 
 
 		 225 aa  41.6  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0601848  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1568  Endopeptidase Clp  27.36 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463332  normal  0.0340848 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  25.19 
 
 		 210 aa  41.6  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  25.93 
 
 		 207 aa  41.2  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1440  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  24.82 
 
 		 218 aa  40.8  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.53484  normal  0.130722 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>