73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1779 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1779    100 
 
 		 275 bp  545  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32190  Transposase, IS4 protein  94.57 
 
 		 981 bp  143  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24590  ISPssy, transposase  94.37 
 
 		 534 bp  109  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  90.12 
 
 		 981 bp  97.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  90.12 
 
 		 981 bp  97.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0915    90.12 
 
 		 979 bp  97.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  90.12 
 
 		 981 bp  97.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  90.12 
 
 		 981 bp  97.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0096  transposase IS4  89.74 
 
 		 984 bp  91.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3208  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 1017 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0135274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4596  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3731  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0359746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3963  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4152  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4253  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4347  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4643  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4702  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4971  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5428  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5440  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5556  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5564  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5582  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0017    89.71 
 
 		 937 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0712662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2887  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00537517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0171  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0534  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0780  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0844  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0902  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0903  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1166  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1188  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.584401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1229  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.520476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1310  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1315  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2008  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2010  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3194  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0837027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2234  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2324  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000979415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2328  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00380976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2836  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2426  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2432  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000860937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2541  ISPssy, transposase  89.71 
 
 		 978 bp  79.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0428    88.73 
 
 		 459 bp  77.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3099  transposase, IS4  86.84 
 
 		 336 bp  71.9  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1407  ISPssy transposase or derivative  88.24 
 
 		 840 bp  71.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286806  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  90.57 
 
 		 981 bp  65.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1356  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 984 bp  61.9  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00477  ISXoo6 transposase  94.87 
 
 		 984 bp  61.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01370  ISXoo6 transposase  94.87 
 
 		 990 bp  61.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01973  hypothetical protein  94.87 
 
 		 216 bp  61.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0141734  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02301  ISXoo6 transposase  94.87 
 
 		 981 bp  61.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03428  ISXoo6 transposase  94.87 
 
 		 963 bp  61.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03937  ISXoo6 transposase  94.87 
 
 		 1218 bp  61.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04439  ISXoo6 transposase  94.87 
 
 		 963 bp  61.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04727  ISXoo6 transposase  94.87 
 
 		 810 bp  61.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.714363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04736  ISXoo6 transposase  94.87 
 
 		 924 bp  61.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2295  transposase IS4 family protein  91.3 
 
 		 984 bp  60  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24610  Transposase, IS4  91.3 
 
 		 144 bp  60  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5627    96.88 
 
 		 495 bp  56  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00519  ISXoo6 transposase  92.31 
 
 		 924 bp  54  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04848  ISXoo6 transposase  96.55 
 
 		 1020 bp  50.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2598  ISRSO18-transposase protein  88.89 
 
 		 960 bp  50.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0605  ISRSO18-transposase protein  88.64 
 
 		 960 bp  48.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0382  ISRSO18-transposase protein  88.64 
 
 		 960 bp  48.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3793  transposase family protein  93.75 
 
 		 981 bp  48.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01501  ISXoo6 transposase  89.74 
 
 		 996 bp  46.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.543852  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4646  hypothetical protein  93.55 
 
 		 186 bp  46.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4095  hypothetical protein  91.43 
 
 		 276 bp  46.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
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