95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3870 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3870  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  100 
 
 
311 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309565  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4570  hypothetical protein  94.21 
 
 
311 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4091  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  94.21 
 
 
311 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1319  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  94.21 
 
 
311 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1584  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  85.21 
 
 
312 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158822  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1414  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  85.53 
 
 
312 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3901  hypothetical protein  84.24 
 
 
312 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4574  hypothetical protein  75.56 
 
 
312 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0566629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52150  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO2  75.56 
 
 
312 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0295092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5679  putative aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  56.36 
 
 
309 aa  332  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3460  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  57.3 
 
 
304 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3524  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  56.93 
 
 
304 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196808  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1756  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  52.03 
 
 
300 aa  315  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2078  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  51.35 
 
 
300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3377  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  54.2 
 
 
304 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3498  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  50.51 
 
 
299 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3981  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  50.17 
 
 
299 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0347  hypothetical protein  50.51 
 
 
299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119011  hitchhiker  0.000140688 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1877  putative aspartyl/asparaginyl BETA-hydroxylase transmembrane protein  50.34 
 
 
300 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4088  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  49.83 
 
 
299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3435  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  49.83 
 
 
299 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2463  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  51.23 
 
 
300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4278  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  49.83 
 
 
299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.309505  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0866  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  48.65 
 
 
300 aa  302  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2325  hypothetical protein  57.36 
 
 
300 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4498  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  48.33 
 
 
299 aa  300  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245223  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3964  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  49.83 
 
 
298 aa  299  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0568  hypothetical protein  51.8 
 
 
299 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474129  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0446  hypothetical protein  51.8 
 
 
299 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0898  hypothetical protein  51.8 
 
 
299 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.838267  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1865  hypothetical protein  51.8 
 
 
299 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2021  beta-hydroxylase  51.8 
 
 
315 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1928  beta-hydroxylase  51.8 
 
 
299 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.101545  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2921  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  48.66 
 
 
316 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51640  Lipopolysaccharide biosynthetic protein  53.49 
 
 
299 aa  291  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.664439  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3770  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  48.83 
 
 
302 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.856849 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4632  membrane-bound beta-hydroxylase  54.62 
 
 
302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4632  membrane-bound beta-hydroxylase  54.62 
 
 
302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569284  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4541  membrane-bound beta-hydroxylase  54.62 
 
 
302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4548  beta-hydroxylase, aspartyl/asparaginyl family  54.62 
 
 
302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4681  membrane-bound beta-hydroxylase  54.62 
 
 
302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03631  aspartyl-asparaginyl beta-hydroxylase  50.35 
 
 
301 aa  288  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5126  hypothetical protein  54.44 
 
 
299 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2028  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  43.65 
 
 
304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961089  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3272  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  48.5 
 
 
299 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58550  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO1  48.84 
 
 
299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2063  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  48.17 
 
 
299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2423  hypothetical protein  48.17 
 
 
299 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.695409  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3076  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  52.69 
 
 
299 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2054  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  49.82 
 
 
300 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332449  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2612  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  48.75 
 
 
299 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0925  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  51.53 
 
 
301 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60975  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0821  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  51.53 
 
 
301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44380  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase family protein  36.17 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238652  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2982  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  35.42 
 
 
248 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1730  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.51 
 
 
262 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44410  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase family protein  34.16 
 
 
255 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0878318  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2383  hypothetical protein  31.02 
 
 
239 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1613  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.08 
 
 
278 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2530  hypothetical protein  31.02 
 
 
239 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1078  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.27 
 
 
267 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.28 
 
 
229 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.784286  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5116  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.28 
 
 
229 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3204  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.28 
 
 
229 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3497  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.05 
 
 
276 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5084  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.26 
 
 
229 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4559  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.26 
 
 
229 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542106  normal  0.524897 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3492  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.78 
 
 
229 aa  93.2  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.405318 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1927  beta-hydroxylase  31.18 
 
 
230 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1863  beta-hydroxylase  31.18 
 
 
230 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0896  beta-hydroxylase  31.18 
 
 
230 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0571  hypothetical protein  31.18 
 
 
230 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2019  beta-hydroxylase  31.18 
 
 
230 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0466  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.69 
 
 
229 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3198  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.67 
 
 
228 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.966263  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0445  asparaginyl beta-hydroxylase  31.69 
 
 
335 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5085  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.11 
 
 
256 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193259  normal  0.545985 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0306  hypothetical protein  31.14 
 
 
252 aa  85.9  8e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.497048  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0971  asparaginyl beta-hydroxylase  30.86 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.916669  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2038  hypothetical protein  28.14 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3143  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.32 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220325  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3011  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  26.67 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1816  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  26.56 
 
 
388 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1745  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  45.16 
 
 
67 aa  62  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3665  Peptide-aspartate beta-dioxygenase  24.87 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3668  Peptide-aspartate beta-dioxygenase  24.74 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406515  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44132  predicted protein  24.65 
 
 
386 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0240855  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44505  predicted protein  33.03 
 
 
521 aa  52.4  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3110  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  25.26 
 
 
399 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46074  predicted protein  26.98 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4194  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.74 
 
 
199 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46818  predicted protein  27.17 
 
 
404 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0165  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.74 
 
 
199 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.187891 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0161  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.63 
 
 
199 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5927  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  22.51 
 
 
311 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0104695  normal  0.0210034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>