54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1745 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1745  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  100 
 
 
67 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2028  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  77.42 
 
 
304 aa  106  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961089  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2325  hypothetical protein  59.68 
 
 
300 aa  84.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3964  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  51.61 
 
 
298 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0347  hypothetical protein  53.23 
 
 
299 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119011  hitchhiker  0.000140688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2063  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  50 
 
 
299 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3272  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  50 
 
 
299 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2423  hypothetical protein  50 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.695409  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3770  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  50.79 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.856849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3076  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  48.39 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5126  hypothetical protein  51.61 
 
 
299 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03631  aspartyl-asparaginyl beta-hydroxylase  55.56 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51640  Lipopolysaccharide biosynthetic protein  51.61 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.664439  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58550  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO1  51.61 
 
 
299 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2054  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  47.54 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332449  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3901  hypothetical protein  51.61 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2921  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  46.77 
 
 
316 aa  67.8  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1584  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  50 
 
 
312 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158822  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4088  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  47.54 
 
 
299 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3435  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  47.54 
 
 
299 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3981  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  47.54 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0925  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  50.79 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60975  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0821  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  50.79 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1414  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  50 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5679  putative aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  51.61 
 
 
309 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3498  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  47.54 
 
 
299 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4278  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  47.54 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.309505  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4498  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  45.9 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245223  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52150  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO2  46.77 
 
 
312 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0295092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4574  hypothetical protein  46.77 
 
 
312 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0566629  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3524  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  46.77 
 
 
304 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196808  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3460  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  46.77 
 
 
304 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4570  hypothetical protein  46.77 
 
 
311 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1319  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  46.77 
 
 
311 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4091  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  46.77 
 
 
311 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3377  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  48.39 
 
 
304 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2612  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  41.94 
 
 
299 aa  62  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0568  hypothetical protein  45.9 
 
 
299 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474129  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0446  hypothetical protein  45.9 
 
 
299 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0898  hypothetical protein  45.9 
 
 
299 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.838267  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2021  beta-hydroxylase  45.9 
 
 
315 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1928  beta-hydroxylase  45.9 
 
 
299 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.101545  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1865  hypothetical protein  45.9 
 
 
299 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3870  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  45.16 
 
 
311 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309565  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0866  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  45.16 
 
 
300 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1877  putative aspartyl/asparaginyl BETA-hydroxylase transmembrane protein  45.16 
 
 
300 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2463  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  45.16 
 
 
300 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2078  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  43.55 
 
 
300 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1756  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  43.55 
 
 
300 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4632  membrane-bound beta-hydroxylase  42.86 
 
 
302 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4632  membrane-bound beta-hydroxylase  42.86 
 
 
302 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569284  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4541  membrane-bound beta-hydroxylase  42.86 
 
 
302 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4548  beta-hydroxylase, aspartyl/asparaginyl family  42.86 
 
 
302 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4681  membrane-bound beta-hydroxylase  42.86 
 
 
302 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>