18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1719 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1719  putative iron uptake protein  100 
 
 		 110 aa  206  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1873  hypothetical protein  73.79 
 
 		 110 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36960  hypothetical protein  58.51 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4468  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4609  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4591  hypothetical protein  45.28 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1212  hypothetical protein  35.51 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25310  membrane protein  35.37 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0855  hypothetical protein  39.58 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0928  hypothetical protein  38.55 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.966724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1323  hypothetical protein  34.02 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0148  putative iron uptake protein  28.95 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1146  hypothetical protein  40.91 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1217  hypothetical protein  40.91 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1147  hypothetical protein  40.91 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.46677  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0264  hypothetical protein  24.42 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4599  putative iron uptake protein  35.29 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1107  hypothetical protein  34.88 
 
 		 120 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.319028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>