18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1040 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1040  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.527359  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4324  hypothetical protein  80.17 
 
 
121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.999559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1399  hypothetical protein  84.26 
 
 
168 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182502  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4413  hypothetical protein  86.32 
 
 
95 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3736  hypothetical protein  40.57 
 
 
133 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0199045  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4461  hypothetical protein  51.52 
 
 
105 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4297  hypothetical protein  44.54 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4001  hypothetical protein  46.36 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3250  hypothetical protein  38.98 
 
 
293 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3134  hypothetical protein  36.54 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3748  hypothetical protein  40 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277851  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2467  hypothetical protein  40.19 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0565  hypothetical protein  36.54 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398065  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  40 
 
 
1834 aa  48.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0835  putative cell division protein FtsK  35.71 
 
 
1725 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.816405  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0315  putative cell division protein FtsK  35.71 
 
 
1725 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1032  putative cell division protein FtsK  35.71 
 
 
1725 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0718321  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1924  cell division protein FtsK, putative  35.71 
 
 
1725 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>