More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3314 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2563  antibiotic biosynthesis protein, putative  88.41 
 
 		 923 aa  1632    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136066  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3314  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 		 923 aa  1868    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3152  amino acid adenylation domain-containing protein  88.84 
 
 		 923 aa  1634    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  35.4 
 
 		 8646 aa  301  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  33.68 
 
 		 6676 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  35.48 
 
 		 2370 aa  298  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3401  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 1084 aa  291  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  31.7 
 
 		 1394 aa  292  3e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  34.74 
 
 		 13537 aa  291  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  34.92 
 
 		 4383 aa  291  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.66 
 
 		 6889 aa  291  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  32.35 
 
 		 4531 aa  290  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  34.46 
 
 		 5953 aa  288  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00170  aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, putative  32.05 
 
 		 1409 aa  288  4e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.682323  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  33.5 
 
 		 3308 aa  287  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  31.93 
 
 		 2752 aa  287  5.999999999999999e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  31.55 
 
 		 1336 aa  287  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  30.35 
 
 		 1421 aa  286  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  35.77 
 
 		 5929 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  33.22 
 
 		 5596 aa  283  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  36.82 
 
 		 1110 aa  282  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  33.62 
 
 		 1336 aa  281  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  34.14 
 
 		 3432 aa  281  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  32.88 
 
 		 2386 aa  280  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  31.21 
 
 		 2156 aa  280  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  34.15 
 
 		 1816 aa  280  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  33.61 
 
 		 2581 aa  279  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  31.44 
 
 		 2156 aa  279  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  29.4 
 
 		 1833 aa  279  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.87 
 
 		 2385 aa  278  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  33.67 
 
 		 1520 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  33.67 
 
 		 1483 aa  278  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  33.67 
 
 		 1483 aa  278  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  35.34 
 
 		 4489 aa  278  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  33.67 
 
 		 1528 aa  278  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  31.31 
 
 		 1556 aa  277  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  33.63 
 
 		 5422 aa  277  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1907  amino acid adenylation domain-containing protein  32.01 
 
 		 625 aa  277  7e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  33.81 
 
 		 5926 aa  277  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  31.22 
 
 		 4968 aa  277  8e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  33.81 
 
 		 4882 aa  277  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.7 
 
 		 2385 aa  276  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0995  amino acid adenylation domain-containing protein  31.39 
 
 		 1284 aa  276  1.0000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.966277  hitchhiker  0.000000137922 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  30.98 
 
 		 1556 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  32.64 
 
 		 2385 aa  276  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3031  amino acid adenylation domain protein  32.91 
 
 		 1466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  31.31 
 
 		 3498 aa  276  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  33.5 
 
 		 3291 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  36.07 
 
 		 2845 aa  275  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.71 
 
 		 2385 aa  275  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  31.05 
 
 		 3086 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  32.8 
 
 		 1345 aa  275  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  31.22 
 
 		 3086 aa  275  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  32.63 
 
 		 2164 aa  275  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  34.04 
 
 		 3650 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  34.13 
 
 		 8914 aa  275  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  36.09 
 
 		 1449 aa  275  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  34.13 
 
 		 4318 aa  274  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  34.21 
 
 		 1525 aa  274  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  34.86 
 
 		 2571 aa  273  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  31.54 
 
 		 1518 aa  273  9e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.65 
 
 		 2385 aa  273  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  31.62 
 
 		 4196 aa  273  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  32.29 
 
 		 2385 aa  273  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  35.26 
 
 		 3328 aa  273  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  34.86 
 
 		 2571 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.29 
 
 		 2385 aa  273  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  35.26 
 
 		 3352 aa  273  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  33.5 
 
 		 3348 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1615  amino acid adenylation domain-containing protein  35.26 
 
 		 3221 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0566356 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5753  amino acid adenylation domain protein  31.87 
 
 		 1525 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  35.26 
 
 		 6072 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  35.26 
 
 		 6081 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  35.26 
 
 		 6006 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  34.25 
 
 		 8915 aa  272  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  30.15 
 
 		 2156 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  32.27 
 
 		 1870 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  32.3 
 
 		 4960 aa  271  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  32.46 
 
 		 4960 aa  271  4e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.12 
 
 		 2385 aa  271  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.12 
 
 		 2385 aa  271  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  31.54 
 
 		 1518 aa  270  7e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  34.91 
 
 		 3231 aa  270  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  34.91 
 
 		 3231 aa  270  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  33.39 
 
 		 9498 aa  270  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  34.05 
 
 		 3165 aa  269  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  34.36 
 
 		 3710 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3090  amino acid adenylation domain protein  32.37 
 
 		 1466 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  34.29 
 
 		 2561 aa  268  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  33.51 
 
 		 5469 aa  268  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  34.56 
 
 		 3219 aa  268  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  33.67 
 
 		 2273 aa  268  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  31.6 
 
 		 1870 aa  268  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  34.84 
 
 		 2614 aa  267  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  34.82 
 
 		 8211 aa  268  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  33 
 
 		 1093 aa  267  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  31.46 
 
 		 1069 aa  266  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  34.13 
 
 		 5467 aa  266  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  33.39 
 
 		 1776 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  30.65 
 
 		 3291 aa  266  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>